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Enregistrement W2028632017 · doi:10.1089/ten.tec.2012.0693

Techniques for the Isolation of High-Quality RNA from Cells Encapsulated in Chitosan Hydrogels

2013· article· en· W2028632017 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueTissue Engineering Part C Methods · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMolecular Biology Techniques and Applications
Établissements canadiensKingston General HospitalQueen's University
Organismes subventionnairesInstitute of Musculoskeletal Health and ArthritisNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésTrizolRNASelf-healing hydrogelsRNA extractionChemistryNucleic acidChitosanChromatographyLysis bufferPolysaccharideEthidium bromideExtraction (chemistry)LysozymeDNAMolecular biologyBiochemistryGeneBiologyPolymer chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Extracting high-quality RNA from hydrogels containing polysaccharide components is challenging, as traditional RNA isolation techniques designed for cells and tissues can have limited yields and purity due to physiochemical interactions between the nucleic acids and the biomaterials. In this study, a comparative analysis of several different RNA isolation methods was performed on human adipose-derived stem cells photo-encapsulated within methacrylated glycol chitosan hydrogels. The results demonstrated that RNA isolation methods with cetyl trimethylammonium bromide (CTAB) buffer followed by purification with an RNeasy® mini kit resulted in low yields of RNA, except when the samples were preminced directly within the buffer. In addition, genomic DNA contamination during reverse transcriptase-polymerase chain reaction (RT-PCR) analysis was observed in the hydrogels processed with the CTAB-based methods. Isolation methods using TRIzol® in combination with one of a Qiaex® gel extraction kit, an RNeasy® mini kit, or an extended solvent purification method extracted RNA suitable for gene amplification, with no evidence of genomic contamination. The latter two methods yielded the best results in terms of yield and amplification efficiency. Predigestion of the scaffolds with lysozyme was investigated as a possible means of enhancing RNA extraction from the polysaccharide gels, with no improvements observed in terms of the purity, yield, or amplification efficiency. Overall, this work highlights the application of a TRIzol®+extended solvent purification method for optimizing RNA extraction that can be applied to obtain reliable and accurate gene expression data in studies investigating cells seeded in chitosan-based scaffolds.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,322
Score d'incertitude au seuil0,407

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,340
Écart entre enseignants0,324 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle