St. John's wort and its constituent hyperforin concordantly regulate expression of genes encoding enzymes involved in basic cellular pathways
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVES AND METHODS: The effects of St. John's wort and hyperforin on gene expression were analysed in HepG2 cells by Affymetrix microarray hybridization and real time reverse transcription-PCR. RESULTS: Both compounds increased mRNAs of the drug metabolizing enzymes CYP3A4, CYP1A1, CYP1A2 and the flavin containing monooxygenase FMO5, and of the multidrug resistance protein MRP2. CYP4F2 and the reduced nicotinamide adenine dinucleotide dehydrogenase NQO1 were downregulated. Expression of genes mediating cholesterol biosynthesis was decreased, while facilitated glucose transporters and glycolysis genes were induced, indicating increased glucose metabolism. Changes of a considerable number of additional transcripts corresponded to reports on gene regulation by hypoxia. Endoplasmic reticulum stress-regulated genes involved in unfolded protein response and in protection of cells from apoptosis were downregulated. Other calcium binding proteins were affected by both treatments, suggesting an increase in intracellular calcium. CONCLUSIONS: St. John's wort and hyperforin concordantly affected expression of genes not only mediating metabolism and transport of exogenous and endogenous compounds, but also involved in energy metabolism, intracellular calcium regulation, cell proliferation and apoptosis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».