Characterization of wheat gluten proteins by hplc and MALDI TOF mass spectrometry
Notice bibliographique
Résumé
We have performed a detailed characterization and identification of wheat gluten proteins obtained from the Teal variety of Canadian hard red spring wheat. RP-HPLC separation of the sample into 35 fractions has reduced the spectral complexity; this was followed by MALDI mass spectrometry (MS), which showed the presence of six or fewer resolved protein components above 20 kDa in each RP-HPLC fraction, giving a total of 93 MS resolved peaks. These included 17 peaks in the omega-gliadin fractions (F1-4), 12 in the high molecular weight (HMW) glutenin subunit fractions (F5-8), 59 in the alpha- and beta-gliadins and low molecular weight (LMW) glutenin subunit fractions (F9-31) and 5 peaks in the gamma-gliadin fractions (F32-35). Peptide maps of tryptic digests of HPLC fractions were obtained from a tandem quadrupole time-of-flight mass spectrometer (MALDI QqTOF MS) and were submitted to the ProFound search engine. HMW glutenin subunits including Ax2*, Dx5, Bx7, and Dy10 (consistent with the known profile of Teal), and LMW glutenin subunits including six from group 3 type II and 1 from group 2 type I, were identified with reasonable sequence coverage from HPLC fraction 5, 7, 17, and 18. The identities of the peptides attributed to selected gluten proteins were confirmed using MS/MS with BioMultiView to match the predicted and measured partial amino acid sequences. Because of incomplete wheat DNA databases, many wheat gluten proteins could not be identified. These results suggest that the combination of RP-HPLC with MS and MS/MS techniques is a promising approach for the characterization of wheat gluten proteins.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».