Molecular Diagnostic Assay for Detection of the Butternut Canker Pathogen <i>Sirococcus clavigignenti-juglandacearum</i>
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Butternut canker, caused by the fungal pathogen Sirococcus clavigignenti-juglandacearum, is present throughout the range of butternut (Juglans cinerea) and is the primary cause for its decline. A quick and reliable method for identification of S. clavigignenti-juglandacearum would provide a valuable tool for the detection of the pathogen on propagative material to avoid spread, as well as assist studies targeted at the epidemiology of this pathogen, in particular the dissemination of the pathogen by seeds of the butternut. The objective of this study was to develop a diagnostic assay to detect S. clavigignenti-juglandacearum in butternut plant tissue. The primers were developed using an alignment of internal transcribed spacer (ITS) sequences from isolates of S. clavigignenti-juglandacearum and several closely related species. These primers were tested on J. cinerea, 48 isolates of S. clavigignenti-juglandacearum recovered from diseased trees, and 26 species of other fungi recovered from butternut tissue. The primers amplified a product from the DNA of all isolates of S. clavigignenti-juglandacearum, detected its DNA at a concentration as low as 1 pg/μl, and detected the pathogen at a concentration of 1 × 10 3 spore/ml. The primers developed in this study will be a valuable tool for the detection of S. clavigignenti-juglandacearum present on butternut seeds, and as a rapid diagnostic tool for early detection of the pathogen on butternut trees.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle