Vibrational Analysis of Methylcobalamin
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Notice bibliographique
Résumé
This work represents the first theoretical attempt to assign vibrational modes for methylcobalamin (MeCbl), the biologically active form of a vitamin B 12 derivative. Full vibrational analysis of MeCbl is currently beyond computational resources; thus, a simplified model, including the actual corrin ring, Im−[Co III (corrin)]−CH 3, was employed in the analysis. The scaled quantum mechanical (SQM) method has been used to refine density functional theory (DFT) based force constants calculated at the B3LYP level of theory. Normal-coordinate analysis based on a six-coordinate MeCbl model permitted assignment of the most important interligand modes. Direct comparison with experimental data showed that the DFT-SQM force field accurately predicts isotope shifts for interligand vibrations corresponding to CH 3 → CD 3 and 12 CH 3 → 13 CH 3 isotope labeling. The DFT-SQM force field for Im−[Co III (corrin)]−CH 3 gives a semiquantitative description of the corrin modes when compared to the Raman spectrum of MeCbl. The analysis of Raman data, together with DFT-computed frequencies, permitted assignment of certain modes located in the 1300−1600 cm -1 range. The calculated modes in this spectral range are mainly composed of single/double CC and CN stretch vibrations. These modes more closely resemble vibrations of connected short linear polyenes rather than modes delocalized over the corrin ring as observed in porphyrins. This localized character most likely is responsible for lack of structure-sensitive modes such as the “core size” marker.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle