A novel thermostable carboxylesterase from Geobacillus thermodenitrificans: evidence for a new carboxylesterase family
Pourquoi ce travail est dans la base
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Notice bibliographique
Résumé
A novel gene encoding an esterase from Geobacillus thermodenitrificans strain CMB-A2 was cloned, sequenced and functionally expressed in Escherichia coli M15. Sequence analysis revealed an open reading frame of 747 bp corresponding to a polypeptide of 249 amino acid residues (named EstGtA2). After purification, a specific activity of 2.58 U mg(-1) was detected using p-NP caprylate (C8) at 50 degrees C and pH 8.0 (optimal conditions). The enzyme catalyses the hydrolysis of triglycerides (tributyrin) and a variety of p-nitrophenyl esters with different fatty acyl chain length (C4-C16). The enzyme has potential for various industrial applications since it is characterized by its activity under a wide range of pH, from 25 to 65 degrees C. Using Geobacillus stearothermophilus Est30 esterase structure as template, a model of EstGtA2 was built using ESyPred3D. Analysis of this structural model allowed identifying putative sequence features that control EstGtA2 enzymatic properties. Based on sequence properties, multiple sequence comparisons and phylogenetic analyses, this enzyme appears to belong to a new family of carboxylesterases.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle