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Enregistrement W2028979879 · doi:10.1371/journal.pone.0032488

Capillary Electrophoresis Separation of Protein Composition of γ-Irradiated Food Pathogens Listeria monocytogenes and Staphylococcus aureus

2012· article· en· W2028979879 sur OpenAlexafffund
Karine Trudeau, Khanh Dang Vu, François Shareck, Monique Lacroix

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueListeria monocytogenes in Food Safety
Établissements canadiensArmand Frappier MuseumInstitut National de la Recherche Scientifique
Organismes subventionnairesArmand-Frappier Foundation
Mots-clésListeria monocytogenesStaphylococcus aureusMicrobiologyRibosomal proteinListeriaBiologyGel electrophoresisProteomeBacteriaChemistryMolecular biologyBiochemistryRibosomeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: A capillary electrophoresis method using UV detection was developed to analyse protein composition of the lysates of two foodborne pathogens, Listeria monocytogenes and Staphylococcus aureus which were previously treated at different irradiation doses. METHODOLOGY AND PRINCIPAL FINDINGS: Bacterial samples were γ-irradiated at different doses to produce damage cells, to kill cells and to provoke viable but non culturable cells (VBNC) in order to evaluate the respective expression of stress proteins. In Listeria monocytogenes, two proteins (MW of 70.2 and 85.4 kDa) were significantly changed (P ≤ 0.05) at different doses of irradiation. In Staphyloccocus aureus, one protein (50 S ribosomal protein) with the MW of 16.3 kDa was significantly decreased at a low dose of irradiation treatment and the other protein (transcriptional regulator CtsR) with the MW of 17.7 kDa was increased significantly (P ≤ 0.05) at all doses of irradiation treatment compared to control. CONCLUSION: Expression of two proteins from the acyltransferase family in Listeria monocytogenes was statistically changed during irradiation treatment (P ≤ 0.05). In Staphylococcus aureus, expression of the 50 S ribosomal protein decreased and the transcriptional regulator CtsR espression increased significantly (P ≤ 0.05) following irradiation treatment. These expressed proteins do not belong to the well-known heat shock proteins family of Listeria monocytogenes and Staphylococcus aureus. The research further confirmed that capillary electrophoresis is a useful method to separate and analyse proteins expression which may be related to the resistance or sensitivity of food pathogens to γ-irradiation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,068
Tête enseignante GPT0,278
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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