Cap-Independent Translational Enhancement by the 3′ Untranslated Region of <i>Red Clover Necrotic Mosaic Virus</i> RNA1
Pourquoi ce travail est dans la base
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Notice bibliographique
Résumé
Red clover necrotic mosaic virus (RCNMV) is a member of the genus Dianthovirus and has a bipartite positive-sense genomic RNA with 3' ends that are not polyadenylated. In this study, we show that both genomic RNA1 and RNA2 lack a 5' cap structure and that uncapped in vitro transcripts of RCNMV RNA1 replicated to a level comparable to that for capped transcripts in cowpea protoplasts. Because the 5' cap and 3' poly(A) tail play important roles in the translation of many eukaryotic mRNAs, genomic RNAs of RCNMV should contain an element(s) responsible for 5' cap- and poly(A) tail-independent translation of viral protein. By using a luciferase reporter assay system in vivo, we showed that the 3' untranslated region (UTR) of RNA1 alone significantly enhanced translation of the luciferase reporter gene in the absence of the 5' cap structure. Deletion studies revealed that the middle region (between nucleotides 3596 and 3732) in the 3' UTR, designated the 3' translation element of Dianthovirus RNA1 (3'TE-DR1), plays an important role in cap-independent translation. This region contained a stem-loop structure conserved among members of the genera Dianthovirus and LUTEOVIRUS: A five-base substitution in the loop abolished cap-independent translational activity, as reported for a luteovirus, indicating that this stem-loop is one of the functional structures in the 3'TE-DR1 involved in cap-independent translation. Finally, we suggest that cap-independent translational activity is required for RCNMV RNA1 replication in protoplasts.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle