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Enregistrement W2029011324 · doi:10.1128/jvi.77.22.12113-12121.2003

Cap-Independent Translational Enhancement by the 3′ Untranslated Region of <i>Red Clover Necrotic Mosaic Virus</i> RNA1

2003· article· en· W2029011324 sur OpenAlex
Hiroyuki Mizumoto, Masahiro Tatsuta, Masanori Kaido, Kazuyuki Mise, Tetsuro Okuno

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueJournal of Virology · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Virus Research Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitute for Chemical Research, Kyoto UniversityNorth Carolina State UniversityJapan Society for the Promotion of ScienceMinistry of Education, Culture, Sports, Science and TechnologyYork UniversityHokkaido University
Mots-clésBiologyPolyadenylationTranslation (biology)Untranslated regionThree prime untranslated regionTranslational regulationMolecular biologyStem-loopRNASubgenomic mRNAVirologyGeneticsMessenger RNAGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Red clover necrotic mosaic virus (RCNMV) is a member of the genus Dianthovirus and has a bipartite positive-sense genomic RNA with 3' ends that are not polyadenylated. In this study, we show that both genomic RNA1 and RNA2 lack a 5' cap structure and that uncapped in vitro transcripts of RCNMV RNA1 replicated to a level comparable to that for capped transcripts in cowpea protoplasts. Because the 5' cap and 3' poly(A) tail play important roles in the translation of many eukaryotic mRNAs, genomic RNAs of RCNMV should contain an element(s) responsible for 5' cap- and poly(A) tail-independent translation of viral protein. By using a luciferase reporter assay system in vivo, we showed that the 3' untranslated region (UTR) of RNA1 alone significantly enhanced translation of the luciferase reporter gene in the absence of the 5' cap structure. Deletion studies revealed that the middle region (between nucleotides 3596 and 3732) in the 3' UTR, designated the 3' translation element of Dianthovirus RNA1 (3'TE-DR1), plays an important role in cap-independent translation. This region contained a stem-loop structure conserved among members of the genera Dianthovirus and LUTEOVIRUS: A five-base substitution in the loop abolished cap-independent translational activity, as reported for a luteovirus, indicating that this stem-loop is one of the functional structures in the 3'TE-DR1 involved in cap-independent translation. Finally, we suggest that cap-independent translational activity is required for RCNMV RNA1 replication in protoplasts.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,521
Score d'incertitude au seuil0,444

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,246
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle