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Enregistrement W2029120392 · doi:10.1128/jvi.05648-11

Changes in the Nasopharyngeal Carcinoma Nuclear Proteome Induced by the EBNA1 Protein of Epstein-Barr Virus Reveal Potential Roles for EBNA1 in Metastasis and Oxidative Stress Responses

2011· article· en· W2029120392 sur OpenAlexafffund
Jennifer Yinuo Cao, Sheila Mansouri, Lori Frappier

Notice bibliographique

RevueJournal of Virology · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA modifications and cancer
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchCanada Research Chairs
Mots-clésBiologyNasopharyngeal carcinomaOxidative stressPeroxiredoxinCarcinogenesisWestern blotSuperoxide dismutaseMolecular biologyCancer researchGeneGeneticsBiochemistryPeroxidaseEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Epstein-Barr virus (EBV) infection is causatively associated with a variety of human cancers, including nasopharyngeal carcinoma (NPC). The only viral nuclear protein expressed in NPC is EBNA1, which can alter cellular properties in ways that may promote oncogenesis. Here, we used 2-dimensional difference gel electrophoresis (2-D DiGE) to profile changes in the nuclear proteome that occur after stable expression of EBNA1 in the EBV-negative NPC cell line CNE2. We found that EBNA1 consistently altered the levels of a small percentage of the nuclear proteins. The identification of 19 of these proteins by mass spectrometry revealed that EBNA1 upregulated three proteins affecting metastatic potential (stathmin 1, maspin, and Nm23-H1) and several proteins in the oxidative stress response pathway, including the antioxidants superoxide dismutase 1 (SOD1) and peroxiredoxin 1 (Prx1). Western blot analysis verified that EBNA1 expression upregulated and EBNA1 silencing downregulated these proteins. In addition, transcripts for stathmin 1 were induced by EBNA1, whereas EBNA1 only affected Prx1 and SOD1 at the protein level. Further investigation of the EBNA1 effects on the redox pathway showed that long-term EBNA1 expression in NPC resulted in increased reactive oxygen species (ROS) and increased levels of the NADPH oxidases NOX1 and NOX2, known to generate ROS. In addition, EBNA1 depletion in EBV-positive cells decreased NOX2 and ROS. The results show multiple roles for EBNA1 in the oxidative stress response pathway and suggest mechanisms by which EBNA1 may promote NPC metastases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,051
Score d'incertitude au seuil0,274

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,265
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations72
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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