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Enregistrement W2029127175 · doi:10.1111/febs.12537

Expression of a type 2 diacylglycerol acyltransferase from <i>Thalassiosira pseudonana</i> in yeast leads to incorporation of docosahexaenoic acid β‐oxidation intermediates into triacylglycerol

2013· article· en· W2029127175 sur OpenAlexafffund
Jingyu Xu, Michael Kazachkov, Yunhua Jia, Zhifu Zheng, Jitao Zou

Notice bibliographique

RevueFEBS Journal · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLipid metabolism and biosynthesis
Établissements canadiensUniversity of SaskatchewanNational Research Council CanadaSaskatchewan Research Council (Canada)
Organismes subventionnairesDow AgroSciencesNational Research Council CanadaSveriges Lantbruksuniversitet
Mots-clésThalassiosira pseudonanaDocosahexaenoic acidBiochemistryDiacylglycerol kinasePolyunsaturated fatty acidEicosapentaenoic acidPeroxisomeYeastAcyltransferaseFatty acidChemistryArabidopsis thalianaBiologyMutantEnzymeGeneOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Glycerolipids of the marine diatom Thalassiosira pseudonana are enriched particularly with eicosapentaenoic acid (EPA), and also with an appreciable level of docosahexaenoic acid (DHA). The present study describes the functional characterization of a type 2 diacylglycerol acyltransferase (DGAT2, EC 2.3.1.20) from T. pseudonana, designated TpDGAT2, which catalyzes the final step of triacylglycerol (TAG) synthesis. Heterologous expression of this gene restored TAG formation in a yeast mutant devoid of TAG biosynthesis. TpDGAT2 was also shown to exert a large impact on the fatty acid profile of TAG. Its expression caused a 10-12% increase of 18:1 and a concomitant decrease of 16:0 relative to that of AtDGAT1(Arabidopsis thaliana). Furthermore, in the presence of the very-long-chain polyunsaturated fatty acids (VLCPUFA) EPA and DHA, TAG formed by TpDGAT2 displayed three- to six-fold increases in the percentage of VLCPUFA relative to that of AtDGAT1 even though TpDGAT2 conferred much lower TAG-synthetic activities than Arabidopsis DGAT1. Strikingly, when fed DHA, the yeast mutant expressing TpDGAT2 incorporated high levels of EPA and DHA isomers derived from DHA β-oxidation. In contrast, no such phenomenon occurred in the cells expressing AtDGAT1. These results suggested that, in addition to the role in breaking down storage lipids, yeast peroxisomes also contribute to lipid synthesis by recycling acyl-CoAs when a fatty acyl assembly system is available to capture and utilize the fatty acyl pools generated via β-oxidation. Our study hence illustrated a case where the efficiency and substrate preference of an acyltransferase can elicit far reaching metabolic adjustments that affect TAG composition.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,014
Score d'incertitude au seuil0,577

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,231
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations25
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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