Molecular data support establishment of a new genus for the lichenicolous species<i>Neobarya usneae</i>(Hypocreales)
Notice bibliographique
Résumé
Neobarya usneae Etayo is a relatively uncommon lichenicolous fungus that forms distinctive obpyriform ascomata on species of Usnea. The species is one of five known lichenicolous species in Neobarya, a genus established in the Clavicipitaceae that contains a variety of mycoparasitic species. The only molecular data for Neobarya species available in GenBank are for unidentified Neobarya species. We obtained sequences of ITS and nrLSU representing a culture and herbarium specimens of N. usneae from New Brunswick, Canada, and from a herbarium specimen of N. parasitica (Fuckel) Lowen, the type species of the genus, collected in Luxembourg, to determine the phylogenetic placement of these species. Our results indicate that N. usneae is not closely related to the type of Neobarya in the Clavicipitaceae, but is instead a member of the Hypocreaceae, the first lichenicolous species known for certain from this Hypocrealean family. Based on these results, we are now establishing a new genus, Lichenobarya, for N. usneae in the Hypocreaceae, and encouraging further study of other Neobarya species to establish their phylogenetic relationships, given the potential for genetic heterogeneity in the group.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».