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Enregistrement W2029204500 · doi:10.1139/g07-106

Identification of stably expressed quantitative trait loci for cooked rice elongation in non-Basmati varieties

2008· article· en· W2029204500 sur OpenAlexvenueno aff
Lanlan Liu, Xin Yan, Ling Jiang, Wei‐Lin Zhang, M. Q. Wang, Shirong Zhou, Yingchao Shen, Yiwen Shen, Shuchen Liu, Liang-Ming CHEN, Jou‐Kou Wang, Jianmin Wan

Notice bibliographique

RevueGenome · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Mapping and Diversity in Plants and Animals
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNatural Science Foundation of Jiangsu ProvinceNational Natural Science Foundation of ChinaChengdu University of Information Technology
Mots-clésBiologyQuantitative trait locusJaponicaInbred strainChromosomeGeneticsElongationJaponica riceGeneBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The elongation of the cooked grain determines the cooking and eating quality of Basmati rice. The identification of stable quantitative trait loci (QTLs), especially those from non-Basmati types, will extend the genetic basis of the Basmati type and facilitate the breeding of high-quality varieties. A set of recombinant inbred lines derived from an indica x japonica hybrid was used to identify QTLs controlling the elongation ratio (ER), elongation index (EI), and water absorption (WA) of the cooked grain. Three ER QTLs on chromosomes 2, 4, and 12, two EI QTLs on chromosomes 2 and 5, and two WA QTLs on chromosomes 2 and 6 were detected. Four of these QTLs were validated using a set of established chromosome segment substitution lines. The genetic effect of qER-2 was explored in an analysis of segregating generations, using 8 newly developed simple sequence repeat markers. Two tightly linked loci (qER-2a and qER-2b) were identified on chromosome 2.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,242
Écart entre enseignants0,220 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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