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Enregistrement W2029222224 · doi:10.1021/bi100891z

Cholesterol in Bilayers with PUFA Chains: Doping with DMPC or POPC Results in Sterol Reorientation and Membrane-Domain Formation

2010· article· en· W2029222224 sur OpenAlexaff
Norbert Kučerka, Drew Marquardt, Thad A. Harroun, Mu‐Ping Nieh, Stephen R. Wassall, Djurre H. de Jong, Lars V. Schäfer, ‪Siewert J. Marrink, John Katsaras

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLipid Membrane Structure and Behavior
Établissements canadiensUniversity of GuelphBrock University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPOPCBilayerChemistryLipid bilayerCrystallographyPolyunsaturated fatty acidCholesterolMembraneFatty acidBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Using neutron diffraction Harroun et al. [(2006) Biochemistry 45, 1227-1233; (2008) Biochemistry 47, 7090-7096] carried out studies that unequivocally demonstrated cholesterol preferentially sequestering in the middle of bilayers (i.e., flat orientation) made of lipids with polyunsaturated fatty acids (PUFA), in contrast to its "usual" position where its hydroxyl group locates near the lipid/water interface (i.e., upright orientation). Here we clearly show, using neutron diffraction, cholesterol's orientational preference in different lipid bilayers. For example, although it requires 50 mol % POPC (16:0-18:1 PC) in DAPC (di20:4 PC) bilayers to cause cholesterol to revert to its upright orientation, only 5 mol % DMPC (di14:0 PC) is needed to achieve the same effect. This result demonstrates not only cholesterol's affinity for saturated hydrocarbon chains, but also its aversion for PUFAs. Molecular dynamics (MD) simulations performed on similar systems show that in high PUFA content bilayers cholesterol is simultaneously capable of assuming different orientations within a bilayer. Although this result is known from previous MD studies by Marrink et al. [(2008) J. Am. Chem. Soc. 130, 10-11], it has yet to be confirmed experimentally. Importantly, MD simulations predict the formation of DMPC-rich domains, data corroborated by experiment (i.e., 10 mol % DMPC-doped DAPC bilayers), where cholesterol preferentially locates in its upright orientation, while in DMPC-depleted domains cholesterol is found mostly in the bilayer center (i.e., flat orientation). These results lend credence to DMPC's aversion for PUFAs, supporting the notion that domain formation is primarily driven by lipids.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,233
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations111
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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