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Enregistrement W2029242138 · doi:10.1158/1538-7445.am10-3269

Abstract 3269: Calpain knockdown in human breast carcinoma cells reduced xenograft tumor growth rates and inhibited in vitro cell migration and proliferation

2010· article· en· W2029242138 sur OpenAlexaff
J H Hu, Bruce E. Elliott, Peter A. Greer

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCalpain Protease Function and Regulation
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCalpainGene knockdownCancer researchBiologyCalpastatinSmall hairpin RNACell growthAnoikisCell migrationCell cultureFocal adhesionMolecular biologyCancer cellCell biologyCancerSignal transductionGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Ubiquitously expressed µ- and m-calpain are calcium dependent intracellular cysteine proteases that have been implicated in the regulation of cell proliferation, survival, apoptosis, migration, and invasion. Stable expression and proteolytic activity of the µ- and m-calpain catalytic subunits (encoded by capn1 and capn2 genes, respectively) requires a common regulatory subunit encoded by the capn4/capns1 gene; thus both µ- and m-calpain activities can be blocked by genetic knockout or knockdown of capn4 expression. Calpain is also regulated by an endogenously expressed inhibitor peptide, calpastain. We screened a panel of human breast cancer and normal epithelial cell lines for expression of calpain and calpastatin. µ- and m-calpain and calpastatin were abundantly expressed in MDA-MB-231, SKBR3, T47D, and MCF-7 breast cancer lines, as well as the normal human breast epithelial cell line MCF-10A. A stably expressed lentivirally encoded shRNA directed against the capn4 transcript was used to effectively knockdown µ- and m-calpain expression and activity in MDA-MB-231 breast cancer cells. This correlated with attenuated proliferation, migration and invasion, but resistance to anoikis. Biochemical analysis also suggests a role for calpain in the regulation of focal adhesion complex proteins such FAK, PTP-1B, talin and F-actin. Finally, knockdown of calpain in MDA-MB-231 cells significantly reduced their ability to form tumors when orthotopically injected into the mammary fat pads of nude mice. These observations provide direct genetic evidence that calpain plays a pro-tumorigenic role in the MDA-MB-231 breast cancer cell model system. Citation Format: {Authors}. {Abstract title} [abstract]. In: Proceedings of the 101st Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2010 Apr 17-21; Washington, DC. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2010;70(8 Suppl):Abstract nr 3269.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,303
Écart entre enseignants0,289 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2010
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