Virulence Characterization of International Collections of the Wheat Stripe Rust Pathogen, <i>Puccinia striiformis</i> f. sp. <i>tritici</i>
Notice bibliographique
Résumé
Wheat stripe rust (yellow rust [Yr]), caused by Puccinia striiformis f. sp. tritici, is an economically important disease of wheat worldwide. Virulence information on P. striiformis f. sp. tritici populations is important to implement effective disease control with resistant cultivars. In total, 235 P. striiformis f. sp. tritici isolates from Algeria, Australia, Canada, Chile, China, Hungary, Kenya, Nepal, Pakistan, Russia, Spain, Turkey, and Uzbekistan were tested on 20 single Yr-gene lines and the 20 wheat genotypes that are used to differentiate P. striiformis f. sp. tritici races in the United States. The 235 isolates were identified as 129 virulence patterns on the single-gene lines and 169 virulence patterns on the U.S. differentials. Virulences to YrA, Yr2, Yr6, Yr7, Yr8, Yr9, Yr17, Yr25, YrUkn, Yr28, Yr31, YrExp2, Lemhi (Yr21), Paha (YrPa1, YrPa2, YrPa3), Druchamp (Yr3a, YrD, YrDru), Produra (YrPr1, YrPr2), Stephens (Yr3a, YrS, YrSte), Lee (Yr7, Yr22, Yr23), Fielder (Yr6, Yr20), Tyee (YrTye), Tres (YrTr1, YrTr2), Express (YrExp1, YrExp2), Clement (Yr9, YrCle), and Compair (Yr8, Yr19) were detected in all countries. At least 80% of the isolates were virulent on YrA, Yr2, Yr6, Yr7, Yr8, Yr17, YrUkn, Yr31, YrExp2, Yr21, Stephens (Yr3a, YrS, YrSte), Lee (Yr7, Yr22, Yr23), and Fielder (Yr6, Yr20). Virulences to Yr1, Yr9, Yr25, Yr27, Yr28, Heines VII (Yr2, YrHVII), Paha (YrPa1, YrPa2, YrPa3), Druchamp (Yr3a, YrD, YrDru), Produra (YrPr1, YrPr2), Yamhill (Yr2, Yr4a, YrYam), Tyee (YrTye), Tres (YrTr1, YrTr2), Hyak (Yr17, YrTye), Express (YrExp1, YrExp2), Clement (Yr9, YrCle), and Compair (Yr8, Yr19) were moderately frequent (>20 to <80%). Virulence to Yr10, Yr24, Yr32, YrSP, and Moro (Yr10, YrMor) was low (≤20%). Virulence to Moro was absent in Algeria, Australia, Canada, Kenya, Russia, Spain, Turkey, and China, but 5% of the Chinese isolates were virulent to Yr10. None of the isolates from Algeria, Canada, China, Kenya, Russia, and Spain was virulent to Yr24; none of the isolates from Algeria, Australia, Canada, Nepal, Russia, and Spain was virulent to Yr32; none of the isolates from Australia, Canada, Chile, Hungary, Kenya, Kenya, Nepal, Pakistan, Russia, and Spain was virulent to YrSP; and none of the isolates from any country was virulent to Yr5 and Yr15. Although the frequencies of virulence factors were different, most of the P. striiformis f. sp. tritici isolates from these countries shared common virulence factors. The virulences and their frequencies and distributions should be useful in breeding stripe-rust-resistant wheat cultivars and understanding the pathogen migration and evolution.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».