Characterization of Human Antigenic Proteins SchS21 and SchS34 from <i>Stachybotrys chartarum</i>
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: SchS21 and SchS34 are proteins from Stachybotrys chartarum sensu latto that are antigenic in goats, mice and humans. Monoclonal antibodies to these proteins react with spores of S. chartarum and S. chlorohalonata but do not cross-react with a diverse taxonomic and ecological array of other fungi. METHODS: Based on partial sequences of the 21- and 34-kDa proteins, obtained from tandem mass spectra and Edman degradation, degenerate primers were designed for touchdown PCR and the resulting amplicons were sequenced. Subsequently, inverse-PCR was used to obtain genomic DNA sequences encoding SchS21 and SchS34. RT-PCR products were sequenced to predict the mature protein sequences of SchS21 and SchS34. Based on the speculation that SchS21 protein was a DNase, the enzymatic properties were investigated. RESULTS: Sequences of 435 and 666 bp in length were obtained from SchS21 and SchS34 cDNAs. The SchS21 open reading frame encodes a mature protein of 144 amino acids, while that of SchS34 is 221 amino acids in length. SchS21 is a secretory, alkaline, Mg-dependent exodeoxyribonuclease, while SchS34 is a secretory protein of unknown function. His-tagged forms of the mature SchS21 and SchS34 proteins were separately overexpressed in Escherichia coli and purified using Ni-NTA columns (0.5 mg/l yield). CONCLUSIONS: Based on Western blots, the expressed proteins were similar in molecular weight and bound to the respective monoclonal antibodies to SchS21 and SchS34 proteins from S. chartarum. Interactions with human sera IgE confirmed the expressed forms of SchS21 and SchS34 as naturally occurring allergens.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».