A new species of nucleo-cytoplasmic large DNA virus (NCLDV) associated with mortalities in Manitoba lake sturgeon Acipenser fulvescens
Notice bibliographique
Résumé
A newly discovered virus, Namao virus, associated with morbidity and mortality, was detected among juvenile lake sturgeon Acipenser fulvescens being propagated by a conservation stocking program for this endangered species in Manitoba, Canada. The outbreaks resulted in cumulative mortalities of 62 to 99.6% among progeny of wild Winnipeg River or Nelson River lake sturgeon and occurred at 2 geographically separate facilities. Namao virus was detected in almost 94% of the moribund or dead lake sturgeon according to a conventional polymerase chain reaction (cPCR) test that is based upon amplification of a 219 bp fragment of the virus major capsid protein (MCP). The virus itself was large (242 to 282 nm) and icosahedral-shaped with 2 capsids and a condensed bar-shaped core. It was found in virus factories within the host cell cytoplasm and displayed a tropism for the integument. Namao virus caused cellular changes characterized by enlarged eosinophilic epithelial cells in the gills and skin. Samples suspected of containing Namao virus did not have cytopathic effects on primary lake sturgeon or established white sturgeon cell lines. However, viral nucleic acid was detected in the former after prolonged incubation periods. Using primers designed from conserved regions of the MCP from NCLDVs, an estimated 95 to 96% of the Namao virus MCP open reading frame was captured. Phylogenetic analysis using the MCP of Namao virus and 27 other NCLDVs suggested that Namao virus and white sturgeon iridovirus share a common evolutionary past and might be members of the family Mimiviridae or a new, as yet unrecognized, virus family.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».