Residue Gln4863 within a Predicted Transmembrane Sequence of the Ca2+ Release Channel (Ryanodine Receptor) Is Critical for Ryanodine Interaction
Notice bibliographique
Résumé
Despite the pivotal role of ryanodine in ryanodine receptor (RyR) research, the molecular basis of ryanodine-RyR interaction remains largely undefined. We investigated the role of the proposed transmembrane helix TM10 in ryanodine interaction and channel function. Each amino acid residue within the TM10 sequence, 4844IIFDITFFFFVIVILLAIIQGLII4867, of the mouse RyR2 was mutated to either alanine or glycine. Mutants were expressed in human embryonic kidney 293 cells, and their properties were assessed. Mutations D4847A, F4850A, F4851A, L4858A, L4859A, and I4866A severely curtailed the release of intracellular Ca2+ in human embryonic kidney 293 cells in response to extracellular caffeine and diminished [3H]ryanodine binding to cell lysates. Mutations F4846A, T4849A, I4855A, V4856A, and Q4863A eliminated or markedly reduced [3H]ryanodine binding, but cells expressing these mutants responded to extracellular caffeine by releasing stored Ca2+. Interestingly these two groups of mutants, each with similar properties, are largely located on opposite sides of the predicted TM10 helix. Single channel analyses revealed that mutation Q4863A dramatically altered the kinetics and apparent affinity of ryanodine interaction with single RyR2 channels and abolished the effect of ryanodol, an analogue of ryanodine, whereas the single channel conductance of the Q4863A mutant and its responses to caffeine, ATP, and Mg2+ were comparable to those of the wild type channels. Furthermore the effect of ryanodine on single Q4863A mutant channels was influenced by the transmembrane holding potential. Together these results suggest that the TM10 sequence and in particular the Q4863 residue constitute an important determinant of ryanodine interaction.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».