MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2029575548 · doi:10.1074/jbc.m306788200

Residue Gln4863 within a Predicted Transmembrane Sequence of the Ca2+ Release Channel (Ryanodine Receptor) Is Critical for Ryanodine Interaction

2003· article· en· W2029575548 sur OpenAlexaff
Ruiwu Wang, Lin Zhang, Jeff Bolstad, Ni Diao, Cindy Brown, Luc Ruest, William H. Welch, Alan J. Williams, S. R. Wayne Chen

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon channel regulation and function
Établissements canadiensUniversité de SherbrookeUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRyanodine receptorMutantBiochemistryExtracellularRyanodine receptor 2Transmembrane domainIntracellularChemistryBiologyTransmembrane proteinMolecular biologyBiophysicsAmino acidReceptorGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Despite the pivotal role of ryanodine in ryanodine receptor (RyR) research, the molecular basis of ryanodine-RyR interaction remains largely undefined. We investigated the role of the proposed transmembrane helix TM10 in ryanodine interaction and channel function. Each amino acid residue within the TM10 sequence, 4844IIFDITFFFFVIVILLAIIQGLII4867, of the mouse RyR2 was mutated to either alanine or glycine. Mutants were expressed in human embryonic kidney 293 cells, and their properties were assessed. Mutations D4847A, F4850A, F4851A, L4858A, L4859A, and I4866A severely curtailed the release of intracellular Ca2+ in human embryonic kidney 293 cells in response to extracellular caffeine and diminished [3H]ryanodine binding to cell lysates. Mutations F4846A, T4849A, I4855A, V4856A, and Q4863A eliminated or markedly reduced [3H]ryanodine binding, but cells expressing these mutants responded to extracellular caffeine by releasing stored Ca2+. Interestingly these two groups of mutants, each with similar properties, are largely located on opposite sides of the predicted TM10 helix. Single channel analyses revealed that mutation Q4863A dramatically altered the kinetics and apparent affinity of ryanodine interaction with single RyR2 channels and abolished the effect of ryanodol, an analogue of ryanodine, whereas the single channel conductance of the Q4863A mutant and its responses to caffeine, ATP, and Mg2+ were comparable to those of the wild type channels. Furthermore the effect of ryanodine on single Q4863A mutant channels was influenced by the transmembrane holding potential. Together these results suggest that the TM10 sequence and in particular the Q4863 residue constitute an important determinant of ryanodine interaction.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,284
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations42
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Biological ChemistryMême sujetIon channel regulation and functionTravaux en français237 207