MétaCan
Menu
Retour à la cohorte

Isolation and nucleotide sequence of a gene encoding tRNA nucleotidyltransferase fromKluyveromyces lactis

2000· article· en· W2029609997 sur OpenAlexaff
Xin Yuan Deng, Pamela J. Hanic‐Joyce, Paul B. M. Joyce

Notice bibliographique

RevueYeast · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA modifications and cancer
Établissements canadiensConcordia University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyKluyveromyces lactisSaccharomyces cerevisiaeBiochemistryTransfer RNAGeneGeneticsMolecular biologyRNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A gene (KlCCA1) encoding ATP(CTP):tRNA specific tRNA nucleotidyltransferase (EC 2.7.7.25) was isolated from Kluyveromyces lactis by complementation of the Saccharomyces cerevisiae cca1-1 mutation. Sequencing of a 2665 bp EcoRI-SpeI restriction fragment revealed an open reading frame potentially encoding a protein of 489 amino acids with 57% sequence similarity to its S. cerevisiae homologue. Southern hybridization revealed a single copy of KlCCA1 in the K. lactis genome. KlCCA1 was able to complement both the mitochondrial and cytosolic defects in the cca1-1 mutant, suggesting that, as in S. cerevisiae, the K. lactis gene encodes a sorting isozyme that is targeted to mitochondria and the nucleus and/or cytosol. An altered KlCCA1 gene encoding a tRNA nucleotidyltransferase that lacked its first 35 amino acids was able to complement the nuclear/cytosolic but not the mitochondrial defect in the S. cerevisiae cca1-1 mutant, suggesting that the 35 amino-terminal amino acids are necessary for targeting to mitochondria but are not required for enzyme activity. Our results suggest that the mechanisms for production and distribution of mitochondrial and nuclear/cytosolic tRNA nucleotidyltransferase in K. lactis differ from those seen in S. cerevisiae.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,063
Score d'incertitude au seuil0,276

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,244
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueYeastMême sujetRNA modifications and cancerTravaux en français237 207