Wolbachia Prophage DNA Adenine Methyltransferase Genes in Different Drosophila-Wolbachia Associations
Notice bibliographique
Résumé
Wolbachia is an obligatory intracellular bacterium which often manipulates the reproduction of its insect and isopod hosts. In contrast, Wolbachia is an essential symbiont in filarial nematodes. Lately, Wolbachia has been implicated in genomic imprinting of host DNA through cytosine methylation. The importance of DNA methylation in cell fate and biology calls for in depth studying of putative methylation-related genes. We present a molecular and phylogenetic analysis of a putative DNA adenine methyltransferase encoded by a prophage in the Wolbachia genome. Two slightly different copies of the gene, met1 and met2, exhibit a different distribution over various Wolbachia strains. The met2 gene is present in the majority of strains, in wAu, however, it contains a frameshift caused by a 2 bp deletion. Phylogenetic analysis of the met2 DNA sequences suggests a long association of the gene with the Wolbachia host strains. In addition, our analysis provides evidence for previously unnoticed multiple infections, the detection of which is critical for the molecular elucidation of modification and/or rescue mechanism of cytoplasmic incompatibility.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».