MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2029719367 · doi:10.1021/bi902173y

The Putative Na<sup>+</sup>/H<sup>+</sup> Antiporter of <i>Vibrio cholerae</i>, Vc-NhaP2, Mediates the Specific K<sup>+</sup>/H<sup>+</sup> Exchange in Vivo

2010· article· fr· W2029719367 sur OpenAlexaff
Craig Resch, Judith L. Winogrodzki, Curtis T. Patterson, Erin J. Lind, Matthew J. Quinn, Pavel Dibrov, Claudia C. Häse

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2010
Typearticle
Languefr
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon Transport and Channel Regulation
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious Diseases
Mots-clésAntiporterAntiportersVibrio choleraeEscherichia coliChemistrySymporterSodium–hydrogen antiporterCytoplasmMembrane transportVesicleBiochemistryTransporterBiophysicsSodiumBacteriaBiologyMembraneGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The existence of bacterial K(+)/H(+) antiporters that prevent the overaccumulation of potassium in the cytoplasm was predicted by Peter Mitchell almost 50 years ago. The importance of K(+)/H(+) antiport for bacterial physiology is widely recognized, but its molecular mechanisms remain underinvestigated. Here, we demonstrate that a putative Na(+)/H(+) antiporter, Vc-NhaP2, protects cells of Vibrio cholerae growing at pH 6.0 from high concentrations of external K(+). Resistance of V. cholerae to Na(+) was found to be independent of Vc-NhaP2. When assayed in inside-out membrane vesicles derived from antiporter-deficient Escherichia coli, Vc-NhaP2 catalyzed the electroneutral K(+)(Rb(+))/H(+) exchange with a pH optimum of approximately 7.75 with an apparent K(m) for K(+) of 1.62 mM. In the absence of K(+), it exhibited Na(+)/H(+) antiport, albeit rather weakly. Interestingly, while Vc-NhaP2 cannot exchange Li(+) for protons, elimination of functional Vc-NhaP2 resulted in a significantly higher Li(+) resistance of V. cholerae cells growing at pH 6.0, suggesting the possibility of Vc-NhaP2-mediated Li(+)/K(+) antiport. The peculiar cation specificity of Vc-NhaP2 and the presence of its two additional paralogues in the same genome make this transporter an attractive model for detailed analysis of the structural determinants of the substrate specificity in alkali cation exchangers.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,223
Écart entre enseignants0,214 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations34
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueBiochemistryMême sujetIon Transport and Channel RegulationTravaux en français237 207