Polyphasic microbial community analysis of petroleum hydrocarbon-contaminated soils from two northern Canadian communities
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
The cold-adapted bacterial communities in petroleum hydrocarbon-contaminated and non-impacted soils from two northern Canadian environments, Kuujjuaq, Que., and Alert, Nunavut, were analyzed using a polyphasic approach. Denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) separation of 16S rDNA PCR fragments from soil total community DNA revealed a high level of bacterial diversity, as estimated by the total number of bands visualized. Dendrogram analysis clustered the sample sites on the basis of geographical location. Comparison of the overall microbial molecular diversity suggested that in the Kuujjuaq sites, contamination negatively impacted diversity whereas in the Alert samples, diversity was maintained or increased as compared to uncontaminated controls. Extraction and sequencing analysis of selected 16S rDNA bands demonstrated a range of similarity of 86-100% to reference organisms, with 63.6% of the bands representing high G+C Gram-positive organisms in the order Actinomycetales and 36.4% in the class Proteobacteria. Community level physiological profiles generated using Biolog GN plates were analyzed by cluster analysis. Based on substrate oxidation rates, the samples clustered into groups similar to those of the DGGE dendrograms, i.e. separation based upon geographic origin. The coinciding results reached using culture-independent and -dependent analyses reinforces the conclusion that geographical origin of the samples, rather than petroleum contamination level, was more important in determining species diversity within these cold-adapted bacterial communities.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,002 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,065 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle