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Enregistrement W2030034737 · doi:10.1139/w05-021

Population and virulence factor dynamics in fecal<i>Escherichia coli</i>from healthy adults consuming weight control diets

2005· article· en· W2030034737 sur OpenAlexvenueno aff
Alexandra L. McOrist, G Veuilett, Michelle S. Vuaran, Anthony R. Bird, Manny Noakes, David L. Topping

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEscherichia coli research studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesJohns Hopkins University
Mots-clésFecesEscherichia coliMicrobiologyVirulenceBiologyPopulationVirulence factorEnterobacteriaceaeFood scienceBiochemistryMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Individual susceptibility to gastrointestinal infection is seen commonly in food poisoning outbreaks, but factors (such as diet) which may modulate this variability are understood poorly. Similarly, factors altering the population dynamics of enteric non-pathogenic Escherichia coli or of pathogenic E. coli containing toxin-signature DNA sequences in the colonic flora of healthy individuals are largely unknown. Feces were collected 4 times over a 12 week period from 41 healthy volunteer adults on a weight control diet (high or low in fiber). E. coli strains were examined by conventional culture followed by PCR for virulence genes stx1, stx2, eae and hlyA, and polymorphic beta-glucuronidase. Total E. coli counts ranged from undetectable to 8.75 log10 CFU/g feces and were unaffected by dietary fiber consumption or gender. Total E. coli counts were correlated positively with age (r = 0.401, P < 0.05). Fifty-eight percent (n = 24) of study individuals harboured more than 1 morph of beta-glucuronidase, indicating the presence of more than 1 strain of E. coli. Virulence genes were detected in 12 of 41 adults, comprising 10 stx1, 3 stx2, 3 eae, and 0 hlyA, but occurrence was not associated with diet, gender, or age. Factors influencing strain mobility over time did not appear to include diet or gender, while the positive relationship between total E. coli numbers and increasing age suggests that some older individuals are "more permissive" to mobile E. coli, including those with toxin genes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,233
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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