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Enregistrement W2030256476 · doi:10.1186/1471-2350-10-117

Genetic variation in the NBS1, MRE11, RAD50 and BLM genes and susceptibility to non-Hodgkin lymphoma

2009· article· en· W2030256476 sur OpenAlex
Johanna M. Schuetz, Amy C. MacArthur, Stephen Leach, Agnes S. Lai, Richard P. Gallagher, Joseph M. Connors, Randy D. Gascoyne, John J. Spinelli, Angela Brooks‐Wilson

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueBMC Medical Genetics · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLymphoma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensSimon Fraser UniversityUniversity of British ColumbiaCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreBC Cancer Agency
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNational Cancer InstituteBC Cancer FoundationMichael Smith Health Research BC
Mots-clésRad50LymphomaDNA repairBiologyGeneticsSingle-nucleotide polymorphismGeneChromosomal translocationPopulationdbSNPCancer researchMedicineGenotypeImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Translocations are hallmarks of non-Hodgkin lymphoma (NHL) genomes. Because lymphoid cell development processes require the creation and repair of double stranded breaks, it is not surprising that disruption of this type of DNA repair can cause cancer. The members of the MRE11-RAD50-NBS1 (MRN) complex and BLM have central roles in maintenance of DNA integrity. Severe mutations in any of these genes cause genetic disorders, some of which are characterized by increased risk of lymphoma. METHODS: We surveyed the genetic variation in these genes in constitutional DNA of NHL patients by means of gene re-sequencing, then conducted genetic association tests for susceptibility to NHL in a population-based collection of 797 NHL cases and 793 controls. RESULTS: 114 SNPs were discovered in our sequenced samples, 61% of which were novel and not previously reported in dbSNP. Although four variants, two in RAD50 and two in NBS1, showed association results suggestive of an effect on NHL, they were not significant after correction for multiple tests. CONCLUSION: These results suggest an influence of RAD50 and NBS1 on susceptibility to diffuse large B-cell lymphoma and marginal zone lymphoma. Larger association and functional studies could confirm such a role.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,347
Score d'incertitude au seuil0,490

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,285
Écart entre enseignants0,268 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle