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Enregistrement W2030279020 · doi:10.1021/jo100575a

Probing the Effect of Acylation on Arabinofuranose Ring Conformation in Di- and Trisaccharide Fragments of Mycobacterial Arabinogalactan

2010· article· en· W2030279020 sur OpenAlex
Chunjuan Liu, Michele R. Richards, Todd L. Lowary

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Organic Chemistry · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEnzyme Production and Characterization
Établissements canadiensAlberta Glycomics CentreUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTrisaccharideArabinogalactanAcylationChemistryRing (chemistry)StereochemistryMicrobiologyBiologyBiochemistryOrganic chemistryPolysaccharideCatalysis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A major component of the cell wall of mycobacteria is the mycolyl-arabinogalactan (mAG) complex. The arabinose and galactose residues in mAG are found solely in the furanose form, and it has been suggested that the flexibility of these five-membered rings allows for the tight packing of mycolic acids. In order to probe the "flexible scaffold hypothesis", we designed and synthesized glycolipids 3-6 and 8-11 as simple models of the terminal portion of mAG. A set of donors and acceptors were explored for preparing the key beta-(1-->2) linkage in 2-6, and the best selectivity and yield can be obtained by using the electron-rich thioglycoside donor 14 and the O-5 p-methoxybenzyl-protected acceptor 17. Both alpha-linkages in the trisaccharides 7-11 were formed in a one-pot reaction. The conformations of compounds 2-11 were studied using solution-state NMR spectroscopy, but little change was observed in the coupling constants for the ring protons between 2 and 3-6 or between 7 and 8-11. However, the rotamer populations about the C-4-C-5 bond for the beta-linked ring in disaccharide 2 did change upon acylation at O-5.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,179

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,003
Tête enseignante GPT0,211
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle