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Enregistrement W2030279291 · doi:10.1073/pnas.120074297

A role of transcriptional activators as antirepressors for the autoinhibitory activity of TATA box binding of transcription factor IID

2000· article· en· W2030279291 sur OpenAlexaff
Tomohiro Kotani, Ken-ichi Banno, Mitsuhiko Ikura, Alan G. Hinnebusch, Yoshihiro Nakatani, Masashi Kawaichi, Tetsuro Kokubo

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Molecular Biology Research
Établissements canadiensOntario Institute for Cancer Research
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTranscription factor II ATATA boxTAF1Transcription factor II DTATA-binding proteinTAF2TATA-Box Binding ProteinTAF4B3 domainTranscription factorCell biologyBiologyChemistryDNA-binding domainGeneticsDNA-binding proteinPromoterGeneEnhancerGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The TATA box-binding activity of transcription factor IID (TFIID) is autoinhibited by the N-terminal domain of the Drosophila TATA box-binding protein- (TBP) associated factor 230/yeast TBP-associated factor 145 subunit, which binds to the TATA box-binding domain of TBP by mimicking the TATA box structure. Here, we propose a mechanism of transcriptional activation that involves antirepression of this autoinhibitory activity by transcriptional activators. Like the autoinhibitory domain of TFIID, various acidic activators interact with the TATA box-binding domain of TBP. Moreover, the autoinhibitory domain of TFIID, which is known to interact with only the TATA box-binding domain of TBP, acts as an activation domain when fused to the GAL4 DNA-binding domain, indicating that interaction with the TATA-binding domain of TBP is crucial for activation of transcription. In a reciprocal fashion, the acidic activation domains can function as the autoinhibitory domain when the latter is replaced by the former within TFIID. These results indicate that activation domains and the autoinhibitory domain of TFIID are interchangeable, supporting a role for transcriptional activators as antirepressors of the autoinhibitory activity of the TATA box binding of TFIID.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,046
Tête enseignante GPT0,290
Écart entre enseignants0,244 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations47
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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