Peptide-Bacteria Interactions using Engineered Surface-Immobilized Peptides from Class IIa Bacteriocins
Notice bibliographique
Résumé
Specificity of the class IIa bacteriocin Leucocin A (LeuA), an antimicrobial peptide active against Gram-positive bacteria, including Listeria monocytogenes , is known to be dictated by the C-terminal amphipathic helical region, including the extended hairpin-like structure. However, its specificity when attached to a substrate has not been investigated. Exploiting properties of LeuA, we have synthesized two LeuA derivatives, which span the amphipathic helical region of the wild-type LeuA, consisting of 14- (14AA LeuA, CWGEAFSAGVHRLA) and 24-amino acid residues (24AA LeuA, CSVNWGEAFSAGVHRLANGGNGFW). The peptides were purified to >95% purity, as shown by analytical RP-HPLC and mass spectrometry. By including an N-terminal cysteine group, the tailored peptide fragments were readily immobilized at the gold interfaces. The resulting thickness and molecular orientation, determined by ellipsometry and grazing angle infrared spectroscopy, respectively, indicated that the peptides were covalently immobilized in a random helical orientation. The bacterial specificity of the anchored peptide fragments was tested against Gram-positive and Gram-negative bacteria. Our results showed that the adsorbed 14AA LeuA exhibited no specificity toward the bacterial strains, whereas the surface-immobilized 24AA LeuA displayed significant binding toward Gram-positive bacteria with various binding affinities from one strain to another. The 14AA LeuA did not show binding as this fragment is most likely too short in length for recognition by the membrane-bound receptor on the target bacterial cell membrane. These results support the potential use of class IIa bacteriocins as molecular recognition elements in biosensing platforms.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».