Electrostatic Potential Derived Atomic Charges for Periodic Systems Using a Modified Error Functional
Notice bibliographique
Résumé
A method to generate electrostatic potential (ESP) derived atomic charges in crystalline solids from periodic quantum mechanical calculations, termed the REPEAT method, is presented. Conventional ESP fitting procedures developed for molecular systems, in general, will not work for crystalline systems because the electrostatic potential in periodic systems is ill-defined up to a constant offset at each spatial position. In this work the problem is circumvented by introducing a new error functional which acts on the relative differences of the potential and not on its absolute values, as it is currently done with molecular ESP charge derivation methods. We formally demonstrate that the new functional reduces to the conventional error functional used in molecular ESP approaches when the simulation box of the periodic calculation becomes infinitely large. Several tests are presented to validate the new technique. For the periodic calculation of isolated molecules, the REPEAT charges are found to be in good agreement with those determined with established molecular ESP charge derivation methods. For siliceous sodalite, it is demonstrated that conventional molecular ESP approaches generate 'unphysical' charges, whereas the REPEAT method produces charges that are both chemically intuitive and consistent between different periodic electronic structure packages. The new approach is employed to generate partial atomic charges of various microporous materials and compared to both experimentally derived and molecular fragment ESP charges. This method can be used to generate partial atomic charges to be used in simulations of microporous and nanoporous materials, such as zeolites and metal organic framework materials.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».