Structure of RavA MoxR AAA+ protein reveals the design principles of a molecular cage modulating the inducible lysine decarboxylase activity
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Notice bibliographique
Résumé
The MoxR family of AAA+ ATPases is widespread throughout bacteria and archaea but remains poorly characterized. We recently found that the Escherichia coli MoxR protein, RavA (Regulatory ATPase variant A), tightly interacts with the inducible lysine decarboxylase, LdcI/CadA, to form a unique cage-like structure. Here, we present the X-ray structure of RavA and show that the αβα and all-α subdomains in the RavA AAA+ module are arranged as in magnesium chelatases rather than as in classical AAA+ proteins. RavA structure also contains a discontinuous triple-helical domain as well as a β-barrel-like domain forming a unique fold, which we termed the LARA domain. The LARA domain was found to mediate the interaction between RavA and LdcI. The RavA structure provides insights into how five RavA hexamers interact with two LdcI decamers to form the RavA-LdcI cage-like structure.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,003 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle