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Enregistrement W2030376296 · doi:10.1021/ac801174r

Impedance Method for Detecting HIV-1 Protease and Screening For Its Inhibitors Using Ferrocene−Peptide Conjugate/Au Nanoparticle/Single-Walled Carbon Nanotube Modified Electrode

2008· article· en· W2030376296 sur OpenAlexafffund
Khaled A. Mahmoud, John H. T. Luong

Notice bibliographique

RevueAnalytical Chemistry · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHIV/AIDS drug development and treatment
Établissements canadiensNational Research Council CanadaBiotechnology Research Institute
Organismes subventionnairesNational Research Council CanadaMcGill University
Mots-clésChemistryConjugatePepstatinSaquinavirDielectric spectroscopyProteaseCombinatorial chemistryElectrodeElectrochemistryEnzymeOrganic chemistryHuman immunodeficiency virus (HIV)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A highly sensitive screening assay based on electrochemical impedance spectroscopy (EIS) has been developed for detecting HIV-1 protease (PR) and subsequent evaluation of its corresponding inhibitors at picomolar levels. The assay format was based on the immobilization of the thiol terminated ferrocene(Fc)-pepstatin conjugate on a single-walled carbon nanotube/gold nanoparticle (SWCNT/AuNP) modified gold electrode. The alteration of the interfacial properties of electrodes upon HIV-1 PR and Fc-pepstatin conjugate interaction was traced by EIS. On the basis of the charge transfer resistance data obtained and using a mixed kinetic and diffusion model, this procedure was capable of detecting picomolar HIV-1 PR owing to the specific binding of this enzyme to Fc modified pepstatin. A competitive inhibition assay format was then performed using four potent HIV-1 PR inhibitors. The estimated inhibition constant ( K i) attested that lopinavir/ritonavir ( K i = 20 +/- 3 pM) and saquinavir ( K i = 57 +/- 8 pM) even at 10 pM competed strongly with pepstatin for effective binding to HIV-1 PR. Indinavir ( K i = 630 +/- 22 pM) only competed well with pepstatin at a much higher concentration (1 nM). No significant inhibitory effect was observed for the fosamprenavir ( K i =11 +/- 0.5 nM) as expected from this pro-drug. Such results agreed well with the values reported in the literature. This assay format is a definite asset for the expedited development of effective HIV-1 PR inhibitors with low molecular weights.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,251
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,055
Tête enseignante GPT0,309
Écart entre enseignants0,254 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations98
Publié2008
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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