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Enregistrement W2030396385 · doi:10.1094/pdis-07-11-0582

First Report of <i>Puccinia graminis</i> f. sp. <i>tritici</i> Races with Virulence to Wheat Stem Rust Resistance Genes <i>Sr31</i> and <i>Sr24</i> in Eritrea

2011· article· en· W2030396385 sur OpenAlexaffabout
Asmelash Wolday, T. G. Fetch, David Hodson, Guangwen Cao, S. C. Brière

Notice bibliographique

RevuePlant Disease · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueWheat and Barley Genetics and Pathology
Établissements canadiensCanadian Food Inspection AgencyAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésStem rustBiologyPucciniaVirulenceCropRace (biology)Lineage (genetic)Veterinary medicineAgronomyBotanyCultivarGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Wheat stem rust, caused by Puccinia graminis f. sp. tritici, has historically been a major limiting factor in wheat production. Identification of isolate Ug99 in Uganda in 1999 highlighted the vulnerability of a large proportion of the global wheat crop and raised international concerns. Since initial detection, seven races have been identified in the Ug99 lineage and occurrence has been confirmed in nine countries (4). During rust surveys of Eritrea undertaken in October 2010, stem rust was found to be widespread throughout the highland wheat-growing areas. Presence of P. graminis f. sp. tritici was recorded in 95% of the 92 cereal fields surveyed, with high disease severity (>40%) recorded at 50 sites. Collected stem rust samples were analyzed for race identity in a level 3 biocontainment laboratory in Canada. Nine collections yielded viable spores for infection studies. Virulence analysis with 20 differentials in the letter-code nomenclature system (1) identified two races from repeated experiments; TTKST (four confirmed isolates) and PTKST (five confirmed isolates). Both races belong to the Ug99 lineage and both exhibit combined Sr31 and Sr24 virulence. TTKST and PTKST differ only in their virulence or avirulence to Sr21, respectively. This first confirmation of TTKST and PTKST in Eritrea is important because it represents further geographical spread of Ug99-related races. Since first detection of a Sr24 variant of Ug99 (race TTKST) in Kenya in 2006 (1), these variants have become the predominant P. graminis f. sp. tritici pathotypes in most of eastern Africa. Race TTKST caused epidemics in Kenya in 2007, and race PTKST was first detected in Ethiopia the same year (T. Fetch, unpublished data). Recent detection of race PTKST in three additional southern Africa countries (South Africa, Zimbabwe, and Mozambique [2,3]) indicates on-going range expansion within the African continent. Sr24-virulent variants of Ug99 are a cause for concern since a high frequency of cultivars from South America, Australia, the United States, and the CIMMYT are known to possess the Sr24 resistance gene. On the basis of observed occurrence and postulated migration routes of the original Ug99 (race TTKSK), the confirmed presence of TTKST and PTKST in Eritrea increases the possibility for range expansion out of Africa by crossing the Red Sea and into the Arabian Peninsula. Future spread of TTKST and PTKST to western Asia is considered highly likely. References: (1) Y. Jin et al. Plant Dis. 92:923, 2008. (2) F. Mukoyi et al. Plant Dis. 95:1188, 2011. (3) Z. A. Pretorius et al. Plant Dis. 94:784, 2010. (4) R. P. Singh et al. Annu. Rev. Phytopathol. 49:465, 2011.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,123
Score d'incertitude au seuil0,390

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,191
Écart entre enseignants0,169 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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