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Enregistrement W2030460944 · doi:10.1139/w07-039

Current and future uses of real-time polymerase chain reaction and microarrays in the study of intestinal microbiota, and probiotic use and effectiveness

2007· review· en· W2030460944 sur OpenAlexafffundvenue
Christine M. Carey, J. Kirk, Shivani Ojha, Magdalena Kostrzynska

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2007
Typereview
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueProbiotics and Fermented Foods
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesAgriculture and Agri-Food Canada
Mots-clésProbioticBiologyIrritable bowel syndromeDNA microarrayPolymerase chain reactionDiseaseMicroarrayMicrobiologyBiotechnologyBacteriaMedicineGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Probiotics are defined as live microorganisms that confer a health benefit to the host when administered in adequate amounts. In addition to human health benefits, probiotics can improve various aspects of growth and performance in livestock and poultry, as well as control undesirable microorganisms in food animals. Studies indicate that probiotics can prevent or treat certain conditions, including atopic disease in infants, food allergy, infection after surgery, acute diarrhea, and symptoms associated with irritable bowel syndrome. Understanding the complete mechanism, effectiveness, and potential use of probiotics is limited by the availability and sensitivity of current methods (i.e., culturing techniques). In recent years, real-time polymerase chain reaction (PCR) and microarrays have become prominent and promising methods to examine quantitative changes of specific members of the microbial community and the influence of probiotics on the structure and function of human and animal intestinal ecosystems. Culture-independent studies have established that only a fraction of organisms present in feces are cultivable, therefore, results obtained by cultivation are limited. Conversely, in-depth knowledge of microbial genomes has enabled real-time PCR and microarrays to be more sensitive and has resulted in precise methods for comprehensive analysis of the complex gut microbiota. Additionally, these technologies can assess the influence of intestinal microorganisms on host metabolism, nutrient status, and disease. This paper reviews method technologies and applications of real-time PCR and microarray assays as they relate to the effect and use of probiotics on the intestinal microbiota and gastrointestinal disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,670
Score d'incertitude au seuil0,592

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,268
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeAutre devis
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations41
Publié2007
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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