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Enregistrement W2030479900 · doi:10.1002/ijc.11458

Aberrant methylation of multiple genes in the upper aerodigestive tract epithelium of heavy smokers

2003· article· en· W2030479900 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Cancer · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensBC Cancer Agency
Organismes subventionnairesNational Cancer Institute
Mots-clésMethylationSputumLung cancerDNA methylationCDH1Cancer researchPathologyGeneTumor suppressor geneCancerBiologyMedicineCarcinogenesisInternal medicineGeneticsGene expressionTuberculosis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

An important method for silencing tumor suppressor genes in cancers is by aberrant methylation (referred to as methylation) of CpG islands in gene promoter regions. In lung cancer, methylation of the genes retinoic acid receptor beta-2 (RARbeta-2), CDH13 (H-cadherin), p16(INK4a) (p16), RASSF1A (RAS association domain family I) is frequent. Thus, we investigated methylation of these genes in 4 different types of specimens (oropharyngeal brushes, sputum samples, bronchial brushes and bronchioloalveolar lavage [BAL] samples) of the upper aerodigestive tract epithelium from heavy smokers without evidence of cancer but with morphometric evidence of sputum atypia and compared the frequencies of methylation in the different types of specimens. In addition, we also analyzed sputum samples from 30 never smokers for methylation of these genes. Our major findings are: (i) At least one gene was methylated in one or more specimens from 48% of the smokers. However, methylation was statistically significant less frequently in never smokers compared to smokers. (ii) In general, methylation occurred more frequently in samples from the central airways (sputum, bronchial brushes) compared to the peripheral airways (BAL) and only occasionally in the oropharynx. (iii) RARbeta-2 was the most frequently methylated gene, whereas the frequency of methylation for the other genes was lower. (iv) Data from sputum samples and bronchial brushes were comparable. Our findings suggest that detection of methylation should be investigated as an intermediate marker for lung cancer risk assessment and response to chemopreventive regimens.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,066
Score d'incertitude au seuil0,192

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,314
Écart entre enseignants0,296 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle