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Enregistrement W2030506720 · doi:10.1152/ajpcell.00439.2006

Identification of a novel interaction between the Ca<sup>2+</sup>-binding protein S100A11 and the Ca<sup>2+</sup>- and phospholipid-binding protein annexin A6

2006· article· en· W2030506720 sur OpenAlexaff
Ning Chang, Cindy Sutherland, Eva Hesse, Robert J. Winkfein, William B. Wiehler, Mark Pho, Claude Veillette, Susan Li, David P. Wilson, Enikö Kiss, Michael P. Walsh

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Physiology-Cell Physiology · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueS100 Proteins and Annexins
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPhospholipidPhosphatidylserineAnnexinChemistryIdentification (biology)Binding siteAnnexin A2BiochemistryBiologyMembraneIn vitro

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

S100A11 is a member of the S100 family of EF-hand Ca(2+)-binding proteins, which is expressed in smooth muscle and other tissues. Ca(2+) binding to S100A11 induces a conformational change that exposes a hydrophobic surface for interaction with target proteins. Affinity chromatography with immobilized S100A11 was used to isolate a 70-kDa protein from smooth muscle that bound to S100A11 in a Ca(2+)-dependent manner and was identified by mass spectrometry as annexin A6. Direct Ca(2+)-dependent interaction between S100A11 and annexin A6 was confirmed by affinity chromatography of the purified bacterially expressed proteins, by gel overlay of annexin A6 with purified S100A11, by chemical cross-linking, and by coprecipitation of S100A11 with annexin A6 bound to liposomes. The expression of S100A11 and annexin A6 in the same cell type was verified by RT-PCR and immunocytochemistry of isolated vascular smooth muscle cells. The site of binding of S100A11 on annexin A6 was investigated by partial tryptic digestion and deletion mutagenesis. The unique NH(2) terminal head region of annexin A6 was not required for S100A11 binding, but binding sites were identified in both NH(2)- and COOH-terminal halves of the molecule. We hypothesize that an agonist-induced increase in cytosolic free [Ca(2+)] leads to formation of a complex of S100A11 and annexin A6, which forms a physical connection between the plasma membrane and the cytoskeleton, or plays a role in the formation of signaling complexes at the level of the sarcolemma.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,020
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,002
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations47
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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