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Enregistrement W2030572778 · doi:10.1128/aac.01537-09

Stage-Dependent Inhibition of HIV-1 Replication by Antiretroviral Drugs in Cell Culture

2009· article· en· W2030572778 sur OpenAlexafffund
Daniel A. Donahue, Richard D. Sloan, Björn D. Kuhl, Tamara Bar-Magen, Susan M. Schader, Mark A. Wainberg

Notice bibliographique

RevueAntimicrobial Agents and Chemotherapy · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueHIV Research and Treatment
Établissements canadiensMcGill UniversityJewish General Hospital
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchMerck CanadaCanadian Foundation for AIDS Research
Mots-clésRaltegravirIntegrase inhibitorReverse transcriptaseViral replicationIntegraseEfavirenzViral loadBiologyProtease inhibitor (pharmacology)VirologyProteaseDrugViral entryPharmacologyReverse-transcriptase inhibitorHuman immunodeficiency virus (HIV)VirusEnzymeAntiretroviral therapyBiochemistryRNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Recent clinical trials have shown that the use of the HIV-1 integrase (IN) inhibitor raltegravir (RAL) results in drops in the viral load that are more rapid than those achieved by use of the reverse transcriptase (RT) inhibitor efavirenz. Previously, mathematical modeling of viral load decay that takes into account the stage of viral replication targeted by a drug has yielded data that closely approximate the clinical trial results. This model predicts greater inhibition of viral replication by drugs that act later in the viral replication cycle. In the present study, we have added drugs that target entry, reverse transcription, integration, or proteolytic processing to acutely infected cells and have shown modest viral inhibition by entry inhibitors, intermediate levels of inhibition by RT and IN inhibitors, and high levels of inhibition by protease inhibitors relative to the levels of growth for the no-drug controls. When dual or triple combinations of these drugs were added to acutely infected cells, we found that the levels of inhibition achieved by any given combination were comparable to those achieved by the latest-acting drug in the combination. In single-round infections in which the kinetics of reverse transcription and integration had been determined by quantitative PCR, addition of IN inhibitors at various times postinfection resulted in levels of inhibition equal to or greater than those achieved by addition of RT inhibitors. Collectively, our data provide in vitro evidence of the stage-dependent inhibition of HIV-1 by clinically relevant drugs. We discuss how stage-dependent inhibition helps to explain the unique viral load decay dynamics observed clinically with RAL.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,252
Écart entre enseignants0,244 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations49
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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