Phylogenetic relationships of the genus<i>Chiropterotriton</i>(Caudata: Plethodontidae) based on 16S ribosomal mtDNA
Notice bibliographique
Résumé
The genus Chiropterotriton contains only 12 described species but includes a rich variety of morphological and ecological forms ranging from diminutive to large cave-dwelling species, as well as a number of terrestrial and arboreal forms. Although morphological diversification has taken place during the evolution of this genus, morphological stasis and parallelism also characterize the evolution of this group, generating complexes of cryptic species. I obtained sequences of the 16S ribosomal mtDNA gene from most of the species. Mitochondrial DNA shows great diversification, with genetic divergence among taxa as high as 12.5%. The 531-bp mtDNA data matrix contained 121 parsimony-informative characters. Basal relationships are poorly supported by maximum parsimony analyses. There is, however, support for a clade that includes all of the samples of the C. chiropterus group. The maximum-likelihood and Bayesian topologies differ from maximum-parsimony topologies mainly in the arrangement of the basal relationships. Based on the results, the genus Chiropterotriton comprises 12 species with available names: C. arboreus, C. chiropterus, C. chondrostega, C. cracens, C. dimidiatus, C. lavae, C. magnipes, C. mosaueri, C. multidentatus, C. orculus, C. priscus, and C. terrestris, plus 7 additional undescribed species for which allozyme and mitochondrial data sets are congruent.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».