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Enregistrement W2030706455 · doi:10.1155/2014/196712

<i>In Vitro</i>Inhibition of Hepatitis C Virus by Antisense Oligonucleotides in PBMC Compared to Hepatoma Cells

2014· article· en· W2030706455 sur OpenAlexaff
Samar Samir Youssef, Ahmed M. Fahmy, Moataza H Omran, Amr Saad Mohamed, Mohamed Ali El Desouki, Mostafa K. El Awady

Notice bibliographique

RevueBioMed Research International · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHepatitis C virus research
Établissements canadiensInstitut National de la Recherche Scientifique
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésInternal ribosome entry sitePeripheral blood mononuclear cellIn vitroVirologyMolecular biologyHepatitis C virusOligonucleotideBiologyMessenger RNATranslation (biology)VirusMedicineDNAGeneBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

AIM: To assess the efficiency of phosphorothioate antisense oligodeoxynucleotide 1 (S-ODN1) on HCV translation inhibition in PBMC compared to hepatoma cells in vitro for the first time. MATERIALS AND METHODS: The study included 34 treatment naive HCV patients. IRES domain III and IV sequence variations were tested in 45 clones from 9 HCV patients. PBMC of HCV positive patients were subjected to S-ODN in vitro. Concomitantly HepG2 cells infected by the same patient's serum were also treated with S-ODN1 for 24 and 48 hours. Cellular RNA was tested for HCV plus and minus strands by reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR). RESULTS: Sequence variations were seen in HCV IRES domain III only while domain IV was conserved among all the tested patient's clones. S-ODN1 successfully inhibited HCV translation in HepG2 cells, while in PBMC inhibition was partial. CONCLUSION: HCV IRES domain IV is more conserved than domain IIId in genotype 4 HCV patients. S-ODN against HCV IRES domain IV was not efficient to inhibit HCV translation in PBMC under the study conditions. Further studies testing other S-ODN targeting other HCV IRES domains in PBMC should be done.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,042
Tête enseignante GPT0,379
Écart entre enseignants0,337 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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