A Three-Dimensional Flow Control Concept for Single-Cell Experiments on a Microchip. 2. Fluorescein Diacetate Metabolism and Calcium Mobilization in a Single Yeast Cell As Stimulated by Glucose and pH Changes
Notice bibliographique
Résumé
Using a three-dimensional flow control concept to manipulate and retain a single yeast cell in a microchip, we were able to study the kinetics of intracellular metabolism and calcium mobilization at the single-cell level, as stimulated by glucose and pH changes. As a model study, the fluorogenic substrate fluorescein diacetate (FDA) was chosen to study how the intracellular carboxylesterase metabolize it. A single yeast cell was first cultured in the microchip. Thereafter, under a constant concentration of FDA, influx of FDA into the yeast cell occurred and FDA was hydrolyzed or metabolized. It was found that changes in both pH and glucose stimulated the FDA metabolism in a yeast cell, and the stimuli can elicit multiple responses from the cell. Since it was carried out within the microchip, the whole experiment on one single yeast cell could last for as long as 10 h. The dormant cell, budding cell, and pretreated budding cell (in low-pH buffer) of yeast resulted in different responses. Experimental data provided details on the FDA metabolism at the single-cell level and revealed strong correlations between FDA metabolism and calcium mobilization. Furthermore, efflux of the FDA metabolite fluorescein could start spontaneously if there was glucose in the medium. The experiments on a single cell were of the "human cell conservation" style because the cell responded to the reagent changes implemented by the human researcher. A mathematical model was also developed to study the influx-hydrolysis-efflux processes of the FDA metabolism using single-cell fluorescent data. These long overdue single-cell experiments are now rendered possible using the three-dimensional flow control in the microchip.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».