The zinc‐finger protein ZFR is critical for Staufen 2 isoform specific nucleocytoplasmic shuttling in neurons
Notice bibliographique
Résumé
In mammalian neurons, transport and translation of mRNA to individual potentiated synapses is believed to occur via a heterogeneous population of RNA granules. To identify components of Staufen2-containing granules, we used the yeast two-hybrid system. A mouse fetal cDNA library was screened with the N-terminal fragment of Staufen2 as bait. ZFR, a three zinc finger protein, was identified as an interacting protein. Confocal microscopy showed that ZFR, although mainly nuclear, was also found in the somatodendritic compartment of primary hippocampal neurons where it localized as granule-like structures. Co-localization with Staufen2 was observed in several granules. Biochemical analyses (immunoprecipitation, cell fractionation) further confirmed the ZFR/Staufen2 association. ZFR was shown to interact with at least the Staufen2(62) isoform, but not with Staufen1. ZFR also co-fractionated with ribosomes and Staufen2(59) and Staufen2(52) in a sucrose gradient. Interestingly, knockdown expression of ZFR through RNA interference in neurons relocated specifically the Staufen2(62), but not the Staufen2(59), isoform to the nucleus. Our results demonstrate that ZFR is a native component of Staufen2-containing granules and likely plays its role during early steps of RNA transport and localization. They also suggest that one of these roles may be linked to Staufen2(62)-containing RNA granule formation in the nucleus and/or to their nucleo-cytoplasmic shuttling.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».