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Enregistrement W2030882363 · doi:10.2196/ijmr.2107

Standardization of Questions in Rare Disease Registries: The PRISM Library Project

2012· article· en· W2030882363 sur OpenAlexvenueno aff
Rachel Richesson, Denise Shereff, James E. Andrews

Notice bibliographique

RevueInteractive Journal of Medical Research · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Rare Diseases
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthU.S. National Library of MedicineUniversity of South FloridaNational Organization for Rare Disorders
Mots-clésStandardizationPrismComputer scienceMedicinePhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Patient registries are often a helpful first step in estimating the impact and understanding the etiology of rare diseases - both requisites for the development of new diagnostics and therapeutics. The value and utility of patient registries rely on the use of both well-constructed structured research questions and relevant answer sets accompanying them. There are currently no clear standards or specifications for developing registry questions, and there are no banks of existing questions to support registry developers. OBJECTIVE: This paper introduces the [Rare Disease] PRISM (Patient Registry Item Specifications and Metadata for Rare Disease) project, a library of standardized questions covering a broad spectrum of rare diseases that can be used to support the development of new registries, including Internet-based registries. METHODS: A convenience sample of questions was identified from well-established (>5 years) natural history studies in various diseases and from several existing registries. Face validity of the questions was determined by review by many experts (both terminology experts at the College of American Pathologists (CAP) and research and informatics experts at the University of South Florida (USF)) for commonality, clarity, and organization. Questions were re-worded slightly, as needed, to make the full semantics of the question clear and to make the questions generalizable to multiple diseases where possible. Questions were indexed with metadata (structured and descriptive information) using a standard metadata framework to record such information as context, format, question asker and responder, and data standards information. RESULTS: At present, PRISM contains over 2,200 questions, with content of PRISM relevant to virtually all rare diseases. While the inclusion of disease-specific questions for thousands of rare disease organizations seeking to develop registries would present a challenge for traditional standards development organizations, the PRISM library could serve as a platform to liaison between rare disease communities and existing standardized controlled terminologies, item banks, and coding systems. CONCLUSIONS: If widely used, PRISM will enable the re-use of questions across registries, reduce variation in registry data collection, and facilitate a bottom-up standardization of patient registries. Although it was initially developed to fulfill an urgent need in the rare disease community for shared resources, the PRISM library of patient-directed registry questions can be a valuable resource for registries in any disease - whether common or rare. TRIAL REGISTRATION: N/A.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,363
Score d'incertitude au seuil0,606

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,415
Écart entre enseignants0,381 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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