Radiographic severity of ankylosing spondylitis is associated with polymorphism of the large multifunctional peptidase 2 gene in the Spondyloarthritis Research Consortium of Canada cohort
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVE: There are limited data on genetic predictors of radiographic progression. The aim of this study was to examine polymorphisms in genes involved in antigen presentation and their effect on radiographic severity and progression. METHODS: Caucasian patients with ankylosing spondylitis (AS) (diagnosed according to the modified New York criteria) from 2 Canadian centers were enrolled. Patients in the progression part of the study had at least 2 sets of radiographs obtained at a minimum gap of 1.5 years, with a modified Stoke Ankylosing Spondylitis Spine Score (mSASSS). Peripheral blood DNA was used for genotyping a panel of 13 coding-region single-nucleotide polymorphisms (SNPs) in ERAP1, LMP2, LMP7, TAP1, and TAP2. Linear regression analysis was performed to identify the predictors of the baseline mSASSS and logistic regression for predictors of progression. Progression was defined as an increase of 1 mSASSS unit per year. RESULTS: A total of 241 AS patients (81% males; 82% HLA-B27-positive) were enrolled from the 2 centers for analysis of the predictors of baseline radiographic severity. In univariate analyses, the baseline mSASSS was associated with sex, disease duration, and SNPs rs30187 (ERAP1) and rs17587 (LMP2). In multivariate analyses, duration of disease (B = 0.74; P = 1 × 10(-11) ), sex (B = 12.1; P = 5 × 10(-5) ), and the LMP2 SNP rs17587 (B = 6.2; P = 0.01) were significantly associated with the baseline mSASSS. In multivariate analyses of progression, only the baseline mSASSS was a significant predictor (B = 0.03; P = 0.003). CONCLUSION: This is the first study to demonstrate that LMP2 variants can affect radiographic severity in AS. The baseline mSASSS remains the strongest predictor of radiographic progression but explains only a fraction of the variability seen.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».