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Enregistrement W2031096741 · doi:10.1002/jmv.20235

Stability of human cytomegalovirus genotypes in persistently infected renal transplant recipients

2004· article· en· W2031096741 sur OpenAlexaff
Richard J. Stanton, D. Westmoreland, Julie D. Fox, Andrew J. Davison, Gavin W. G. Wilkinson

Notice bibliographique

RevueJournal of Medical Virology · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCytomegalovirus and herpesvirus research
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesMedical Research Council
Mots-clésGenotypeHuman cytomegalovirusBiologyVirologyVirusGeneCytomegalovirusBetaherpesvirinaeTransplantationHerpesviridaeGenetic variationViral diseaseGeneticsImmunologyMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Although most genes are highly conserved among strains of human cytomegalovirus (HCMV), several are unusually variable. By analyzing the sequence of two variable genes (UL146 and UL74) amplified directly from whole blood DNA extracts, multiple HCMV strains were detected in blood samples from 5/11 virus-infected renal transplant patients. These five patients were seronegative prior to transplantation and their likely acquisition of the virus was via the donated organ; HCMV-positive immunocompetent donors may thus be capable of harboring and transmitting multiple virus genotypes. In sequential samples taken up to 140 days post transplant no mutations in either gene were detected from 9/10 patients, and in the remaining patient a single nucleotide change was detected in UL146, and none in UL74. All sequences grouped into previously defined genotypes, with the detection of multiple members of the UL74 group 5 genotype establishing this previously tentative genotype. Additionally, identical sequences were identified in viruses from different patients, including examples from geographically distinct regions. Thus, although UL146 and UL74 exhibit impressive variation among strains, their sequences are maintained stably within and between infected individuals, suggesting that sequence differences between genotypes may be driven by differing gene function.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,371
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,041
Tête enseignante GPT0,339
Écart entre enseignants0,298 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations67
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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