Stability of human cytomegalovirus genotypes in persistently infected renal transplant recipients
Notice bibliographique
Résumé
Although most genes are highly conserved among strains of human cytomegalovirus (HCMV), several are unusually variable. By analyzing the sequence of two variable genes (UL146 and UL74) amplified directly from whole blood DNA extracts, multiple HCMV strains were detected in blood samples from 5/11 virus-infected renal transplant patients. These five patients were seronegative prior to transplantation and their likely acquisition of the virus was via the donated organ; HCMV-positive immunocompetent donors may thus be capable of harboring and transmitting multiple virus genotypes. In sequential samples taken up to 140 days post transplant no mutations in either gene were detected from 9/10 patients, and in the remaining patient a single nucleotide change was detected in UL146, and none in UL74. All sequences grouped into previously defined genotypes, with the detection of multiple members of the UL74 group 5 genotype establishing this previously tentative genotype. Additionally, identical sequences were identified in viruses from different patients, including examples from geographically distinct regions. Thus, although UL146 and UL74 exhibit impressive variation among strains, their sequences are maintained stably within and between infected individuals, suggesting that sequence differences between genotypes may be driven by differing gene function.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».