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Enregistrement W2031142335 · doi:10.1186/s12917-014-0187-6

Assessment of Toll-like receptor 2, 4 and 9 SNP genotypes in canine sino-nasal aspergillosis

2014· article· en· W2031142335 sur OpenAlexaboutno aff
Elise Mercier, Iain R. Peters, Frédéric Farnir, Rachel Lavoué, Michael Day, Cécile Clercx, Dominique Peeters

Notice bibliographique

RevueBMC Veterinary Research · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSinusitis and nasal conditions
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSingle-nucleotide polymorphismBiologyPathogenesisGenotypingGenotypeSNPGeneticsSNP genotypingCoding regionImmunologyMinor allele frequencyTLR2AlleleAspergillosisAllele frequencyInnate immune systemGeneReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The exact aetiology of canine sino-nasal aspergillosis (SNA) is unknown. In man, dysfunction in innate immunity, particularly in the function of pattern recognition receptors, is implicated in the pathogenesis of inflammatory sino-nasal disease and in fungal diseases. Associations between single nucleotide polymorphisms (SNPs) in Toll-like receptors (TLRs) and these diseases have been identified. Similarly, in dogs SNPs in genes encoding TLRs may be important in the pathogenesis of SNA. The aims of the present study were (1) to identify the presence of non-synonymous SNPs in the coding regions of the TLR2, 4 and 9 genes in dogs suffering from SNA, and (2) to investigate the SNP genotypes in dogs with SNA compared with a control population. RESULTS: Direct sequencing of nine dogs of various breeds with SNA revealed two non-synonymous SNPs in the coding region of TLR2, eight in TLR4 and four in TLR9. These non-synonymous SNPs were further evaluated in a case-control study of affected Golden Retrievers, Labrador Retrievers, Rottweilers and Beaucerons. Genotyping was performed using a combination of allele-specific primers and hydrolysis probe assays in 31 dogs with SNA and 31 controls. No significant difference in minor allele frequency was identified between these groups, for all studied SNPs, in any of the four breeds. CONCLUSIONS: These findings do not support a role for non-synonymous SNPs in the TLR 2, 4 and 9 coding regions in the pathogenesis of canine SNA, but do not exclude a role for innate immunity in the pathogenesis of the disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,317
Score d'incertitude au seuil0,618

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,216
Tête enseignante GPT0,464
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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