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Enregistrement W2031147265 · doi:10.1139/w08-152

Characterization of bacterial and fungal communities in composted biosolids over a 2 year period using denaturing gradient gel electrophoresis

2009· article· en· W2031147265 sur OpenAlexafffundvenue
Amy Novinscak, Nadine J. DeCoste, Céline Surette, Martin Filion

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueComposting and Vermicomposting Techniques
Établissements canadiensUniversité de Moncton
Organismes subventionnairesMitacs
Mots-clésTemperature gradient gel electrophoresisCompostBiosolidsMicroorganismBiologyMicrobial population biologyEcological successionColonizationBacteriaFood scienceBotanyAgronomyMicrobiologyEnvironmental science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Composting is a microbial process that converts organic waste into a nutrient-rich end product used in horticultural and agricultural applications. The diversity and long-term succession of microorganisms found in composted biosolids has been less characterized than other composts. In this study, bacterial and fungal communities found in composted biosolids aging from 1 to 24 months were studied using denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) and sequencing. The results revealed high levels of diversity, where 53 bacterial species belonging to 10 phyla and 21 fungal species belonging to 4 phyla were identified. Significant differences were observed when comparing the bacterial DGGE patterns of young compost samples, whereas no differences were observed in samples over 8 months. For fungal patterns, no significant differences were observed during the first 4 months of composting, but the diversity then significantly shifted until 24 months. The results indicate that patterns of bacterial species vary during the first few months of composting, whereas fungal patterns generally vary throughout the whole process, except during early stages. The description of the main microbial groups found in composted biosolids could find various applications, including the discovery of biotechnologically relevant microorganisms and the development of novel markers allowing quantitative monitoring of key microorganisms.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,822
Score d'incertitude au seuil0,600

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,206
Écart entre enseignants0,191 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations31
Publié2009
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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