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Enregistrement W2031319026 · doi:10.1094/phyto-05-13-0140-r

Viruses Associated with Rusty Mottle and Twisted Leaf Diseases of Sweet Cherry Are Distinct Species

2013· article· en· W2031319026 sur OpenAlexfundno aff
D. E. V. Villamor, Kenneth C. Eastwell

Notice bibliographique

RevuePhytopathology · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Virus Research Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesAgriculture and Agri-Food CanadaAnimal and Plant Health Inspection ServiceWashington State UniversityU.S. Department of Agriculture
Mots-clésBiologyCladeMottlePhylogenetic treePlant virusVirologyBotanyVirusVirus classificationPrunusPotyvirusGeneticsGeneGenome

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Virus RNA sequences related to those of the family Betaflexiviridae were amplified from trees affected with the following diseases: cherry twisted leaf, apricot ring pox, cherry necrotic rusty mottle, cherry rusty mottle, and cherry green ring mottle. Phylogenetic analysis of virus sequences obtained from these diseased trees from western North America, along with published sequences of Cherry green ring mottle virus (CGRMV) and Cherry necrotic rusty mottle virus (CNRMV), revealed four major clades. Segregation into these four populations correlated with distinct symptom expression on woody indicators, suggesting that each clade represents a distinct virus species within the family Betaflexiviridae. The viruses occupying each clade were designated clade I: Cherry twisted leaf associated virus, clade II: CNRMV, clade III: Cherry rusty mottle associated virus, and clade IV: CGRMV. Potential recombination events were predicted to occur within and between these viruses, the latter being strongly supported by incongruent phylogenies. Examination of frequency distribution data derived from pairwise sequence comparisons of coat protein coding sequences resulted in a proposal for alternative guidelines for species demarcation for this family of viruses.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,246
Score d'incertitude au seuil0,316

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,043
Tête enseignante GPT0,241
Écart entre enseignants0,199 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations35
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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