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Enregistrement W2031465149 · doi:10.1111/icad.12118

Polydnavirus gene provides accurate identification of species in the genus <i>Hyposoter</i> (Hymenoptera: Ichneumonidae)

2015· article· en· W2031465149 sur OpenAlexafffund
Victoria G. Pook, Eric G. Chapman, Daniel H. Janzen, Winnie Hallwachs, M. Alex Smith, Michael J. Sharkey

Notice bibliographique

RevueInsect Conservation and Diversity · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueHymenoptera taxonomy and phylogeny
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesInternational Conservation Fund of CanadaOntario Genomics InstituteGovernment of CanadaGuanacaste Dry Forest Conservation FundUniversity of Kentucky
Mots-clésBiologyIchneumonidaeHymenopteraPhylogenetic treeSubfamilyParasitoidEvolutionary biologyParasitoid waspIntraspecific competitionZoologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Accurate identification of species of parasitoid Hymenoptera often requires the analysis of multiple genetic and non‐genetic traits. Here, we investigate the potential for nuclear polydnavirus (PDV) gene loci to provide species‐level discrimination in the parasitoid wasp genus Hyposoter (Hymenoptera: Ichneumonidae). A region of one PDV gene, Cys‐d9.2 , was sequenced from nine species of wasps and an additional two PDV genes, Cys‐d9.1 and Rep‐c18.2 , were sequenced from multiple specimens of one species of wasp. A Bayesian phylogenetic analysis of the Cys‐d9.2 sequences resulted in accurate identification of species and no intraspecific variation was observed in this gene, Cys‐d9.1 or Rep‐c18.2 . Further statistical analyses showed that Cys‐d9.2 has a high prevalence of non‐synonymous nucleotide substitutions. Our results support the use of Cys‐d9.2 as an additional genetic locus for species delimitation in Hyposoter , highlighting the value of PDV gene information to taxonomists studying the ichneumonid subfamily, Campopleginae.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,089
Tête enseignante GPT0,225
Écart entre enseignants0,136 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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