Polydnavirus gene provides accurate identification of species in the genus <i>Hyposoter</i> (Hymenoptera: Ichneumonidae)
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Accurate identification of species of parasitoid Hymenoptera often requires the analysis of multiple genetic and non‐genetic traits. Here, we investigate the potential for nuclear polydnavirus (PDV) gene loci to provide species‐level discrimination in the parasitoid wasp genus Hyposoter (Hymenoptera: Ichneumonidae). A region of one PDV gene, Cys‐d9.2 , was sequenced from nine species of wasps and an additional two PDV genes, Cys‐d9.1 and Rep‐c18.2 , were sequenced from multiple specimens of one species of wasp. A Bayesian phylogenetic analysis of the Cys‐d9.2 sequences resulted in accurate identification of species and no intraspecific variation was observed in this gene, Cys‐d9.1 or Rep‐c18.2 . Further statistical analyses showed that Cys‐d9.2 has a high prevalence of non‐synonymous nucleotide substitutions. Our results support the use of Cys‐d9.2 as an additional genetic locus for species delimitation in Hyposoter , highlighting the value of PDV gene information to taxonomists studying the ichneumonid subfamily, Campopleginae.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».