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Enregistrement W2031803717 · doi:10.1073/pnas.1200934109

Caspase-7 uses an exosite to promote poly(ADP ribose) polymerase 1 proteolysis

2012· article· en· W2031803717 sur OpenAlexafffund
Dave Boucher, Véronique Blais, Jean‐Bernard Denault

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCell death mechanisms and regulation
Établissements canadiensUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesUniversité de SherbrookeCanadian Institutes of Health ResearchUniversité Laval
Mots-clésPoly ADP ribose polymeraseProteolysisCaspaseNLRP1PolymeraseBiologyCaspase 2Cleavage (geology)BiochemistryCaspase 3Cell biologyCaspase 8Caspase-9C-terminusMolecular biologyEnzymeApoptosisAmino acidProgrammed cell death

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

During apoptosis, hundreds of proteins are cleaved by caspases, most of them by the executioner caspase-3. However, caspase-7, which shares the same substrate primary sequence preference as caspase-3, is better at cleaving poly(ADP ribose) polymerase 1 (PARP) and Hsp90 cochaperone p23, despite a lower intrinsic activity. Here, we identified key lysine residues (K(38)KKK) within the N-terminal domain of caspase-7 as critical elements for the efficient proteolysis of these two substrates. Caspase-7's N-terminal domain binds PARP and improves its cleavage by a chimeric caspase-3 by ∼30-fold. Cellular expression of caspase-7 lacking the critical lysine residues resulted in less-efficient PARP and p23 cleavage compared with cells expressing the wild-type peptidase. We further showed, using a series of caspase chimeras, the positioning of p23 on the enzyme providing us with a mechanistic insight into the binding of the exosite. In summary, we have uncovered a role for the N-terminal domain (NTD) and the N-terminal peptide of caspase-7 in promoting key substrate proteolysis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,024
Score d'incertitude au seuil0,245

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,303
Écart entre enseignants0,272 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations131
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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