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Enregistrement W2031840862 · doi:10.1186/s12870-014-0389-x

A comparison of induced and developmental cell death morphologies in lace plant (Aponogeton madagascariensis) leaves

2014· article· en· W2031840862 sur OpenAlexafffund
Adrian N. Dauphinee, Trevor S Warner, Arunika H. L. A. N. Gunawardena

Notice bibliographique

RevueBMC Plant Biology · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCell death mechanisms and regulation
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaKillam TrustsDalhousie University
Mots-clésProgrammed cell deathBiologyVacuoleCell biologyOrganelleMulticellular organismAutophagyApoptosisNecrosisPlant cellBotanyCellCytoplasmBiochemistryGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Programmed cell death (PCD) is an important process for the development and maintenance of multicellular eukaryotes. In animals, there are three morphologically distinct cell death types: apoptosis, autophagic cell death, and necrosis. The search for an all-encompassing classification system based on plant cell death morphology continues. The lace plant is a model system for studying PCD as leaf perforations form predictably via this process during development. This study induced death in cells that do not undergo developmental PCD using various degrees and types of stress (heat, salt, acid and base). Cell death was observed via live cell imaging and compared to the developmental PCD pathway. RESULTS: Morphological similarities between developmental and induced PCD included: disappearance of anthocyanin from the vacuole, increase in vesicle formation, nuclear condensation, and fusing of vesicles containing organelles to the vacuole prior to tonoplast collapse. Plasma membrane retraction was a key feature of developmental PCD but did not occur in all induced modes of cell death. CONCLUSIONS: Regardless of the causal agent in cell death, the vacuole appeared to play a central role in dying cells. The results indicated that within a single system, various types and intensities of stress will influence cell death morphology. In order to establish a plant cell death classification system, future research should combine morphological data with biochemical and molecular data.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,076
Score d'incertitude au seuil0,445

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,269
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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