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Enregistrement W2031853963 · doi:10.1007/s11745-014-3921-8

A Novel Assay of DGAT Activity Based on High Temperature GC/MS of Triacylglycerol

2014· article· en· W2031853963 sur OpenAlexaff
Michael S. Greer, Ting Zhou, Randall J. Weselake

Notice bibliographique

RevueLipids · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLipid metabolism and biosynthesis
Établissements canadiensAlberta InnovatesUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMicrosomeAcyl-CoAChemistryBiochemistrySubstrate (aquarium)EnzymeChromatographyDiacylglycerol kinaseAcyltransferasesSpecific activityEnzyme assayGlycerolMass spectrometryTransferaseBiosynthesisBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Diacylglycerol acyltransferase (DGAT) catalyzes the final step in the acyl-CoA-dependent biosynthesis of triacylglycerol (TAG), a high-energy compound composed of three fatty acids esterified to a glycerol backbone. In vitro DGAT assays, which are usually conducted with radiolabeled substrate using microsomal fractions, have been useful in identifying compounds and genetic modifications that affect DGAT activity. Here, we describe a high-temperature gas chromatography (GC)/mass spectrometry (MS)-based method for monitoring molecular species of TAG produced by the catalytic action of microsomal DGAT. This method circumvents the need for radiolabeled or modified substrates, and only requires a simple lipid extraction prior to GC. The utility of the method is demonstrated using a recombinant type-1 Brassica napus DGAT produced in a strain of Saccharomyces cerevisae that is deficient in TAG synthesis. The GC/MS-based assay of DGAT activity was strongly correlated with the typical in vitro assay of the enzyme using [1-(14)C] acyl-CoA as an acyl donor. In addition to determining DGAT activity, the method is also useful for determining substrate specificity and selectivity properties of the enzyme.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,030
Score d'incertitude au seuil0,520

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,215
Écart entre enseignants0,209 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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