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Enregistrement W2031881762 · doi:10.1038/oby.2009.71

Association of <i>OSBPL11</i> Gene Polymorphisms With Cardiovascular Disease Risk Factors in Obesity

2009· article· en· W2031881762 sur OpenAlexafffund
Luigi Bouchard, Geneviève Faucher, André Tchernof, Yves Deshaies, Simon Marceau, Odette Lescelleur, Simon Biron, Claude Bouchard, Louis Përusse, Marie‐Claude Vohl

Notice bibliographique

RevueObesity · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCholesterol and Lipid Metabolism
Établissements canadiensUniversité LavalUniversité de MontréalUniversité du Québec à Chicoutimi
Organismes subventionnairesInstitute of Nutrition, Metabolism and DiabetesCanadian Institutes of Health ResearchUniversité LavalHeart and Stroke Foundation of CanadaSanofi
Mots-clésSingle-nucleotide polymorphismMinor allele frequencyInternal medicineObesityMetabolic syndromeOdds ratioMedicineEndocrinologyDiabetes mellitusGenotypeSNPBiologyAlleleBioinformaticsGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The prevalence of morbid obesity and its associated metabolic complications has risen rapidly in the past decade. Recently, we have established the transcriptome of the visceral adipose tissue of nondiabetic severely obese men with and without metabolic syndrome (MetS) that provided new candidate genes for cardiovascular disease (CVD) risk factors. The oxysterol-binding protein-like protein 11 (OSBPL11) that belongs to the OSBP family of intracellular receptors was one of the genes found to be significantly overexpressed in the MetS group. To determine whether OSBPL11 gene polymorphisms are associated with CVD risk factors and diabetes, OSBPL11 gene promoter and coding regions were sequenced in 25 individuals and six tagging single-nucleotide polymorphisms (SNPs) capturing 85% of gene sequence-derived common genetic variability (minor allele frequency (MAF) > 5%) were genotyped in two samples for a total of 962 obese individuals. Using a multistage experimental design, chi(2)-tests and logistic regressions were applied to compare genotype frequencies and to compute odds ratios (ORs) for low and high CVD risk groups. Significant associations between rs1055419 and diastolic blood pressure (OR = 0.53; P = 0.01) were found whereas IVS12+95 T>C, a newly discovered SNP, was associated with low-density lipoprotein-cholesterol levels (OR = 1.63; P < 0.001), hyperglycemia/diabetes (OR = 1.48; P < 0.004) as well as with MetS per se (OR = 1.56; P < 0.01). These results suggest that the OSBPL11 gene is involved in cholesterol and glucose metabolism in obese individuals.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,534

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,204
Écart entre enseignants0,196 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations37
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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